液相色譜質(zhì)譜是指樣品中各組分經(jīng)液相色譜儀分離后先后經(jīng)適用的接口導(dǎo)入質(zhì)譜儀中，被離子源電離成具有一定質(zhì)荷比的碎片離子，由質(zhì)量分析器分離而被檢測，后由計算機(jī)處理得到碎片離子組成的單一組分的質(zhì)譜圖，再由質(zhì)譜圖鑒定出該組分的結(jié)構(gòu)組成。液相色譜和質(zhì)譜聯(lián)機(jī)的關(guān)鍵是選用適合的接口，即要將大氣壓條件下的色譜分離和氣化與質(zhì)譜高真空條件下的電離連接。
液相色譜質(zhì)譜的連接技術(shù)主要有大氣壓離子化技術(shù)，如電噴霧電離、大氣壓化學(xué)電離、大氣壓光電離和基體輔助激光解吸電離技術(shù)等。其中ESI和APCI接口是現(xiàn)有液相色譜質(zhì)譜用儀器中為普遍的接口。接口技術(shù)的成功開發(fā)使液相色譜質(zhì)譜用儀在生物、醫(yī)藥、化工、農(nóng)業(yè)和環(huán)境等領(lǐng)域中得以廣泛應(yīng)用。液相色譜質(zhì)譜用結(jié)合了液相色譜儀有效分離熱不穩(wěn)性及高沸點(diǎn)化合物的分離能力與質(zhì)譜儀很強(qiáng)的組分鑒定能力，其應(yīng)用范圍極廣。
但液相色譜質(zhì)譜用的缺點(diǎn)是試樣組分在進(jìn)入離子源前必須去除溶劑，故沸點(diǎn)與溶劑相近或低的組分不能檢測；由于溶劑很難揮發(fā)干凈，本底效應(yīng)較高，不利于分辨；沒有商品化的譜庫可對比查詢，只能自建譜庫或自己解析譜圖。液相色譜質(zhì)譜用儀主要用于非揮發(fā)性化合物、極性化合物、熱不穩(wěn)定化合物和大相對分子質(zhì)量化合物（包括蛋白、多肽、多聚物等）等的分析測定。在土壤科學(xué)研究中主要應(yīng)用于農(nóng)藥獸藥的殘留物、環(huán)境污染物及化感物質(zhì)等有機(jī)物的定性和定量分析。
