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菌落計數(shù)儀的使用是體現(xiàn)菌落總數(shù)檢驗結(jié)果的準(zhǔn)確性，直接影響這些產(chǎn)品衛(wèi)生安全性評價的可靠性。
菌落計數(shù)需要2人分別使用菌落計數(shù)儀，以2人計數(shù)結(jié)果的平均值報告菌落數(shù)。通常認(rèn)為不同稀釋度間的誤差及同稀釋度兩平行平板間的誤差均不應(yīng)超過10％~1，若其誤差超過，其結(jié)果不可采用。
平板上的蔓延菌落一般不予計數(shù)。若有必要對其計數(shù)時，鏈狀菌落如僅有1條鏈，可視為個菌落；如有不同來源的幾條鏈，則應(yīng)將每條鏈作為1個菌落計。若蔓延菌落不到平板的50％，而其余50％中菌落分布又很均勻，即可計算 50％的平板后乘2以代表全平板菌落數(shù)。
采取冷凍狀態(tài)下進(jìn)行平板菌落計數(shù)的方法是不正確的。必須嚴(yán)格按照樣品的解凍條件要求，待樣品*解凍后，再實施檢驗 ，此結(jié)果才能更客觀地反映樣品實際的污染程度。  

在成像硬件上迅數(shù)公司*了宣撫使暗視野微生物菌落觀察裝置菌落計數(shù)儀，它*改變傳統(tǒng)的光照原理和培養(yǎng)皿觀察方法，構(gòu)成對微生物菌落的高清晰、高精確的觀察和圖像采集。將菌落置于全封閉的暗視野內(nèi)，利用光學(xué)原理計算出符合一定角度的光，通過折射、衍射和反射的效果，對菌落形成極其清晰的空間立體影像效果。與傳統(tǒng)的觀察和圖像采集相比，有效提高菌落與背景的對比度、提高對微小菌落的識別度、以及對雜質(zhì)的區(qū)別度。
在圖像獲取上G系列自動菌落分析儀上采用了F/1.4大光圈鏡頭，其銳利的光學(xué)影像通過1000萬像素的真彩CMOS轉(zhuǎn)化為數(shù)字影像，超清晰展現(xiàn)培養(yǎng)皿表層和深層的細(xì)微菌落。全封閉、寬光帶、懸浮式暗視野照明系統(tǒng)，保證菌落計數(shù)精度的基本要求是獲得清晰、背景平整的圖像，消除外界雜散光的干擾。迅數(shù)公司對G系列的照明系統(tǒng)進(jìn)行精密的設(shè)計，上下光源采用了寬光帶的LED柔光系統(tǒng)，并結(jié)合設(shè)計的懸浮式暗視野，不僅消除了玻璃培養(yǎng)皿的折射光斑，通過改變光比，使得菌落表面的皺折、凹陷、邊緣的鋸齒更富立體感。
分析軟件是菌落計數(shù)儀的另一塊核心成分，在軟件上迅數(shù)全自動菌落計數(shù)分析儀具備*的綜合智能分析系統(tǒng)，由迅數(shù)獨立研發(fā)的“迅數(shù)"colonfast菌落智能識別技術(shù)，融合了通用分割、多通道分割、同色分割等多種圖像處理算法，適合各種復(fù)雜的培養(yǎng)皿。