全流程免疫肽組學(xué)服務(wù)：從樣本到新抗原篩選檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

腫瘤miǎnyìzhìliáo迎來了跨越式發(fā)展，從免疫檢查點(diǎn)抑制劑到個(gè)體化疫苗、TCR-T細(xì)胞療法，jīngzhǔn激活T細(xì)胞識(shí)別腫瘤的能力被視為未來治療的重要方向。新抗原（Neoantigen），即由腫瘤tèyǒu基因突變產(chǎn)生的新肽段，因其高度非自我屬性，成為誘導(dǎo)腫瘤特異性免疫反應(yīng)的理想靶點(diǎn)。然而，新抗原的篩選遠(yuǎn)非易事。通過體外算法預(yù)測(cè)MHC結(jié)合肽段的方法，雖具備一定通量，但仍面臨假陽(yáng)性率高、功能不確定等瓶頸。尤其是在個(gè)體化治療背景下，僅靠預(yù)測(cè)模型已無法滿足臨床與研發(fā)對(duì)新抗原真實(shí)呈遞狀態(tài)的需求。在此背景下，免疫肽組學(xué)（Immunopeptidomics） 作為一種直接解析MHC復(fù)合物中呈遞肽段的質(zhì)譜技術(shù)，正逐漸成為新抗原發(fā)現(xiàn)的關(guān)鍵手段。相比預(yù)測(cè)，免疫肽組學(xué)提供了實(shí)測(cè)視角，使研究者能夠直接識(shí)別在生理?xiàng)l件下由MHC分子呈遞的真實(shí)肽段，為新抗原驗(yàn)證和靶點(diǎn)開發(fā)提供了更具生物學(xué)意義的依據(jù)。

一、免疫肽組學(xué)的技術(shù)原理與流程解析

免疫肽組學(xué)的核心在于，通過免疫共沉淀技術(shù)富集MHC分子，并釋放其結(jié)合的短肽后，借助高分辨率質(zhì)譜進(jìn)行鑒定，從而還原抗原呈遞的真實(shí)圖譜。技術(shù)流程包括以下關(guān)鍵步驟：

1、樣本準(zhǔn)備

支持腫瘤組織、細(xì)胞系、PBMC等多種樣本來源，前處理過程中需zuì大程度保留抗原肽的完整性，避免降解。

2、MHC免疫共沉淀（IP）

利用特異性抗體富集MHC-I或MHC-II復(fù)合物，確保肽段來源的專一性，是整個(gè)流程成敗的關(guān)鍵。

3、肽段釋放與純化

通過溫和的酸處理將短肽從MHC分子中釋放，再經(jīng)固相萃取等方式進(jìn)行純化，去除雜質(zhì)和非特異性干擾。

4、質(zhì)譜分析（LC-MS/MS）

應(yīng)用高分辨率質(zhì)譜設(shè)備（如Orbitrap Exploris或timsTOF），針對(duì)長(zhǎng)度通常在8–15個(gè)氨基酸的短肽進(jìn)行jīngzhǔn識(shí)別與定量。

5、數(shù)據(jù)庫(kù)匹配與新抗原篩選

將質(zhì)譜結(jié)果與基于患者突變信息（如WES/RNA-seq）構(gòu)建的個(gè)性化肽段數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，識(shí)別其中可能的突變來源肽，即潛在新抗原。

二、技術(shù)挑戰(zhàn)與關(guān)鍵優(yōu)化點(diǎn)

免疫肽組學(xué)的優(yōu)勢(shì)顯著，但技術(shù)門檻也相對(duì)較高，尤其在以下幾個(gè)方面需要jīngzhǔn控制：

1、低豐度肽段的富集能力

新抗原多為低豐度表達(dá)，優(yōu)化MHC抗體選擇與IP條件至關(guān)重要。

2、短肽的質(zhì)譜靈敏度與識(shí)別效率

與常規(guī)蛋白組學(xué)相比，免疫肽組學(xué)更依賴高靈敏度設(shè)備與jīngzhǔn的質(zhì)譜參數(shù)設(shè)定。

3、高置信度的肽段鑒定算法

數(shù)據(jù)處理需結(jié)合多重算法（如NetMHCpan、MixMHCpred）與嚴(yán)格的FDR控制，保障結(jié)果的準(zhǔn)確性。

三、應(yīng)用價(jià)值：連接數(shù)據(jù)與靶點(diǎn)的橋梁

免疫肽組學(xué)技術(shù)正在逐漸成為連接組學(xué)數(shù)據(jù)與治療靶點(diǎn)的核心橋梁。其應(yīng)用jiàzhítǐxiàn在多個(gè)層面：

• 用于個(gè)體化腫瘤疫苗或T細(xì)胞治療靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)

• 評(píng)估腫瘤免疫原性及抗原逃逸機(jī)制

• 研究病毒感染或自身免疫病中的抗原呈遞譜

• 作為藥物作用機(jī)制或毒性反應(yīng)的輔助評(píng)估手段

特別是在jīngzhǔn醫(yī)療領(lǐng)域，免疫肽組學(xué)的引入使得抗原驗(yàn)證不再僅是預(yù)測(cè)+驗(yàn)證的被動(dòng)模式，而是從一開始就立足于真實(shí)被呈遞的角度，提高研發(fā)效率與臨床轉(zhuǎn)化的成功率。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白zhìzǔxué分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

全流程免疫肽組學(xué)服務(wù)：從樣本到新抗原篩選檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹