基于肽組學(xué)的抗原發(fā)現(xiàn)與預(yù)測(cè)檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在miǎnyìzhìliáo、疫苗研發(fā)以及傳染病防控等領(lǐng)域，jīngzhǔn鎖定有效抗原是整個(gè)策略的起點(diǎn)。依賴基因組測(cè)序和生物信息學(xué)預(yù)測(cè)來(lái)尋找潛在抗原的方法能快速生成候選靶點(diǎn)清單，但存在兩個(gè)現(xiàn)實(shí)問(wèn)題：其一，預(yù)測(cè)結(jié)果未必會(huì)在實(shí)際生理環(huán)境中呈遞給T細(xì)胞；其二，不同算法和數(shù)據(jù)庫(kù)的偏差可能導(dǎo)致高比例的假陽(yáng)性靶點(diǎn)，增加后續(xù)驗(yàn)證成本。而肽組學(xué)（peptidomics）的出現(xiàn)，提供了更貼近生物現(xiàn)實(shí)的解決方案。該技術(shù)通過(guò)高分辨質(zhì)譜直接解析來(lái)源于主要組織相容性復(fù)合體（MHC）的結(jié)合肽，揭示免疫系統(tǒng)在特定疾病狀態(tài)下實(shí)際展示的分子片段。這意味著科研人員可以在海量dànbáizhì背景中，直接捕捉那些真正參與免疫應(yīng)答的肽段，從而大幅提升新抗原發(fā)現(xiàn)的準(zhǔn)確性和效率。如今，從腫瘤新抗原疫苗到病毒變異株防控，肽組學(xué)正成為免疫學(xué)研究的重要尋寶圖。它通過(guò)質(zhì)譜直接解析來(lái)源于主要組織相容性復(fù)合體（MHC）的結(jié)合肽，揭示免疫系統(tǒng)實(shí)際呈遞給T細(xì)胞的分子信息，使抗原發(fā)現(xiàn)從理論推演走向?qū)嶒?yàn)驗(yàn)證。

一、肽組學(xué)的技術(shù)原理與實(shí)驗(yàn)流程

肽組學(xué)是蛋白zhìzǔxué的一個(gè)重要分支，專注于分析體內(nèi)天然存在的短肽分子。其核心目標(biāo)是在復(fù)雜生物樣品中鑒定和定量這些短肽，尤其是與MHC結(jié)合的免疫相關(guān)肽。實(shí)驗(yàn)流程通常包括：

1、免疫親和純化（Immunoaffinity Purification）

利用特異性抗體捕獲細(xì)胞表面的MHC-I或MHC-II分子，連同其結(jié)合的肽一起富集。該步驟的關(guān)鍵在于抗體的高特異性與洗脫條件的溫和性，確保保留肽的完整結(jié)構(gòu)。

2、肽釋放與分離

通過(guò)酸解或有機(jī)溶劑將MHC結(jié)合肽釋放下來(lái)，再經(jīng)高效液相色譜（LC）分離，減少?gòu)?fù)雜背景干擾。

3、高分辨率質(zhì)譜檢測(cè)（LC-MS/MS）

利用Orbitrap、Q-TOF等高分辨質(zhì)譜平臺(tái)進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析，測(cè)定肽的jīngquè分子質(zhì)量與碎片模式，實(shí)現(xiàn)氨基酸序列解析。

4、數(shù)據(jù)解析與抗原預(yù)測(cè)

通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索比對(duì)肽段來(lái)源蛋白，并結(jié)合免疫信息學(xué)工具（如NetMHCpan、MHCflurry）預(yù)測(cè)其MHC結(jié)合能力與免疫原性。

二、肽組學(xué)在抗原發(fā)現(xiàn)中的核心優(yōu)勢(shì)

1、從預(yù)測(cè)走向驗(yàn)證

（1）預(yù)測(cè)：依賴算法推斷HLA結(jié)合肽，易受數(shù)據(jù)庫(kù)和模型偏差影響。

（2）肽組學(xué)驗(yàn)證：直接捕獲天然MHC結(jié)合肽，反映真實(shí)免疫呈遞狀態(tài)。

2、生理相關(guān)性高

肽組學(xué)得到的序列是細(xì)胞實(shí)際表面呈遞的抗原，能排除體外表達(dá)但不被MHC加載的假陽(yáng)性靶點(diǎn)。

3、多場(chǎng)景適用性

（1）腫瘤免疫：發(fā)現(xiàn)腫瘤特異性突變肽，用于個(gè)性化新抗原疫苗設(shè)計(jì)。

（2）傳染病防控：解析病毒感染后MHC呈遞的病原相關(guān)肽，輔助疫苗研發(fā)。

（3）自身免疫機(jī)制研究：識(shí)別異常呈遞的自身肽段，探索發(fā)病機(jī)制。

三、抗原預(yù)測(cè)的計(jì)算支撐

即便獲得了大量實(shí)測(cè)免疫肽，預(yù)測(cè)工具依然重要，尤其是在篩選高潛力候選抗原時(shí)。

1、結(jié)合親和力預(yù)測(cè)：基于深度學(xué)習(xí)模型計(jì)算肽與MHC分子的結(jié)合強(qiáng)度。

2、免疫原性評(píng)估：預(yù)測(cè)肽-MHC復(fù)合物激活T細(xì)胞的可能性。

3、多組學(xué)整合：結(jié)合轉(zhuǎn)錄組、dànbáizhì組信息，剔除低表達(dá)或不翻譯的背景肽。

四、從實(shí)驗(yàn)室到臨床的挑戰(zhàn)

1、低豐度肽檢測(cè)難度大

對(duì)質(zhì)譜靈敏度、背景噪聲抑制及樣品處理工藝要求jígāo。

2、HLA多樣性

不同個(gè)體的HLA等位基因差異顯著，需要構(gòu)建多樣化參考數(shù)據(jù)庫(kù)。

3、數(shù)據(jù)解讀復(fù)雜

抗原呈遞機(jī)制受多種因素影響，包括蛋白降解途徑、肽加載機(jī)制及細(xì)胞類(lèi)型。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白zhìzǔxué分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

基于肽組學(xué)的抗原發(fā)現(xiàn)與預(yù)測(cè)檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹